MeRIP-seq-南宫28NG相信品牌力量-RNA甲基化测序技术

南宫NG·28(中国)相信品牌力量有限公司

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RNA甲基化（MeRIP-seq）

RNA甲基化（MeRIP-seq） RNA 的 m⁶A 修饰

MeRIP-seq（RNA甲基化免疫共沉淀，Methylated RNA Immunoprecipitation）：通过m6A抗体富集发生m6A甲基化的RNA片段，对IP的RNA片段进行高通量测序，在全转录组范围内研究发生m6A甲基化程度较高的区域。

MeRIP-seq示意图

热点研究：
mRNA的m⁶A修饰。

应用方向

1. 不同植物的生物学功能研究：植物中的m6A RNA修饰，参与调控植物的各方面生物学功能。
2. 癌症发生和转移、疾病发生、发展： m6A修饰参与调节生物体中多种生物学过程，与多种疾病发生、发展显著相关。
3. 细胞分化、胚胎发育和压力应答等： m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译、细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。

诺禾优势

1. 项目文章以及物种经验丰富
南宫28NG相信品牌力量已经成功完成对人、小鼠、猪、牛、鸡、病毒、草莓、番茄、玉米、烟草、棉花等多个物种的MeRIP-seq分析，助力客户在Hepatology、Nature Communications、Observational Study、Genome Biology、Cancer Research等权威杂志发表多篇高水平文章。
2. 全面降低医口样本人、小鼠送样量门槛
南宫28NG相信品牌力量研发微量MeRIP-seq建库技术，total RNA使用量低至2 μg。
3. 生信分析内容丰富
诺禾MeRIP-seq基于文章中高频出现的分析内容，搭建完成MeRIP-seq与RNA-seq、MeRIP-seq与ncRNA关联分析流程。且input样本可作为转录组分析定量信息。
4. 科学的方案设计
从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。
5. 周期快、质量好、稳定性高
南宫28NG相信品牌力量基于全面的物种实验库以及优质的测序平台，实现快速、稳定的测序数据分析及交付。
- <10
  样本量
- 50D
  周期
- NovaSeq
  X plus
  测序平台

信息分析

南宫28NG相信品牌力量 MeRIP 测序项目对质检合格的RNA样本进行IP实验及建库测序，获得高质量 reads，通过 motif 分析判断 IP 的特异性以及分析的可信性，高效预测相关基因，进行功能富集分析，构建m⁶A修饰图谱。

MeRIP-seq	分析内容	解决问题
标准分析	测序数据质量评估	过滤低质量数据，保证数据质量
	参考序列比对分析	唯一比对的 reads 分布统计
	Peak calling	检出发生 m6A 修饰的可信区域
	Motif 分析	蛋白结合序列的偏好性
	Peak 峰相关基因注释	Peak 在基因组及转录本功能区上的分布
	差异 peak 分析	分析不同样本间差异 peak 峰
	相关基因功能分析	Peak 相关基因 GO,KEGG 富集分析
个性化分析、多组学关联分析需联系产品经理进行评估。

关联分析

基于文章高频出现的MeRIP-seq多组学关联分析内容，诺禾搭建了关联分析流程，助力高分文章发表：

MeRIP-seq与RNA-seq关联分析	1. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因维恩图
	2. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因分析GO 富集分析
	3. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因分析KEGG 富集分析
MeRIP-seq与ncRNA-seq关联分析	1. 全基因组范围内m6A Peak分类与注释
	2. 差异Peak分类与注释
	3. 差异Peak注释基因GO富集分析
	4. 差异Peak注释基因KEGG富集分析