人类重测序送样建议-南宫28NG相信品牌力量

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    送样建议

    人类重测序

    声明:
    实验室不接收《人间传染的病原微生物名录》(点击查看)的所有样品。对于高毒性动植物等样品,必须事先通过销售、客服或运营经理与南宫28NG相信品牌力量技术人员联系,确定无高致病性和传染性后才能寄送样品。
    提取风险提示和注意事项:核酸提取质量与物种及组织部位、采集方法及保存状态、提取方法及操作、实验器材及环境等因素均有密不可分的联系,尤其是三代超长提取对样本的要求更高。组织提取时可能受到上下游处理操作的影响,因此较难保证单次提取满足质量要求,客户应在寄送组织样品前进行备份。为了保障获得高质量的核酸,请务必按照送样手册所规定的准备样本。对珍贵样本或者微量样本,建议自行提取。取样过程中,需要全程佩戴手套,并且使用预冷乙醇对取样器材进行擦拭消毒,以免样本污染

    1. 人类重测序

    • 1.1 组织样本

      a. 新鲜组织:黄豆大小1~2粒(约0.1g),液氮速冻后,-80℃保存(可以保存在RNALater中,切记不要保存在TRIzol中)
      b. 血液:≥1mL,EDTA抗凝管(紫色盖子)或加EDTA/柠檬酸钠抗凝剂,-80℃保存,避免反复冻融(抗凝剂不能用肝素/肝素钠)
      c. 细胞系:≥5*106个细胞;加细胞冻存液(血清+10%DMSO),液氮慢冻/收集得到细胞沉淀,液氮速冻
      d. 提取cf/ctDNA:血浆:≥3mL;血清:≥3mL;脑脊液样本 :≥4mL;分装于1.5mL无核酸酶离心管中,-80℃保存;客户自提cfDNA:总量>30ng,体积>10μL,干冰运输。
      【注】公司不接收全血样本提取cfDNA,溶血样品不能纳入试验选样,存放周期超过1年的血浆(清)样本不建议送样提取;脑部肿瘤由于血脑屏障的存在,血浆不适合进行cfDNA研究,一般推荐取脑脊液样本提取cfDNA
      e. FFPE贴片/卷片:厚度在5-10μm,含组织面积大于25mm2的切片6张,尽量保证组织中恶性肿瘤细胞所占比例较大,至少超过60%,贴片取样会有损失,建议送样量加倍
      f. 石蜡块:组织体积>1.5cm3
      g. 唾液:≥4mL,清水漱口1~2次,然后吐掉,漱口后等候至少5分钟方可采集唾液,在30分钟内采集4mL唾液(不含泡沫),等体积保存液倒在采集管中,充分颠倒混匀,常温保存
      h. 毛发:>20根,毛发必须含有毛囊
      i. 拭子:>4个
      【注】样本制备时,口腔内壁需多摩擦一会,尽量取到多的口腔细胞。
    • 1.2 核酸样本

      文库类型 浓度 体积 总量 备注
      人外显子 >24ng/μl 20μl≤V≤120μl >500ng(建议1ug) 针对核酸有杂质、污染、粘稠、颜色等情况,需要过柱纯化后送样 或者酌情增加送样量
      DNA小片段文库 >24ng/μL 20μL≤V≤120μL >400ng

    2 样本打包及寄送建议

    • 2.1 样本的打包

      (1)核酸样品建议使用质量好的1.5ml或2ml 低吸附EP管装载样品,并用封口膜封口。为了防止样品管破裂,或者污染和混乱,请不要使用诸如PCR管、0.5ml EP管、八联管、96孔板、深孔板等非标准管送样。非标准管不利于样品保存以及后续实验的进行。如有样品使用非标准管制备,还请在送样前自行转管处理。
      (2)组织样本建议根据送样量使用合适规格带螺纹帽的EP管、冻存管或者离心管装载组织样品,并用封口膜封口。
      (3)为防止样品管在运输过程中受到干冰挤压破裂,最好将样品管放到50ml离心管或其他支撑物中,并在支撑物里添加棉花或卫生纸缓冲。大量样品建议将EP管放置在冻存盒中,并在冻存盒外面包裹气泡垫。如使用锡箔纸、自封袋装载的样品,为防止运输中受挤压破损,建议将锡箔纸折叠整齐装在自封袋中,在样品包装外再用气泡垫包好并固定。
      (4)对于血液样品,建议采用5-10ml 塑料抗凝采血管装载,为了防止运输过程中采血管因挤压而损坏,需要将每支采血管管身均用气泡垫包好,然后放置到塑料或纸质包装盒中。
      (5)用乙醇沉淀的样品由于运输中会有少量乙醇挥发出,建议将样品管盖用封口膜缠绕4-5圈。
      (6)为便于处理和保存,组织样品送样量请不要超过建议送样量的5倍(特殊的得率较低的样品除外)。
    • 2.2 样本的名称标识

      (1)所有的样品必须具有清晰的标记,并且简洁明了。
      (2)使用锡箔纸包装的组织样品建议在锡箔纸内外均标记样品名称,并将锡箔纸放在自封袋中,自封袋外面再标记上样品名称,防止锡箔纸上样品名称模糊引起样品混乱。
      (3)使用乙醇沉淀的核酸样品,由于挥发出的乙醇会使记号笔的标记模糊,建议用油性记号笔将样品名称写在标签纸上,然后用透明胶带将标签纸粘贴在样品管壁上,并缠绕2-3圈。
      (4)样品名称建议使用“字母+数字”命名方式标注在管盖。其他信息如日期、浓度、物种等可标注在管壁。所有标注内容需与《样品信息单》保持一致。

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